Au Moyen-Âge, Prignac en Médoc était un village fortifié. Il abritait un prieuré comprenant un cimetière et une chapelle. Le prieuré régulier de Prignac, qui dépendait de l’abbaye de Chancelade, près de Périgueux, servait d’asile et de réconfort aux pélerins qui étaient guidés tout au long du chemin par les croix jacquaires dont de magnifiques exemplaires se trouvent toujours rue du Moulin et au lieu-dit Lafon, près de la cave coopérative. La chapelle, après la disparition du couvent, devint l’église paroissiale que l’on peut encore admirer aujourd’hui.
Datant du XIIè siècle, elle est dépourvue de clocher et ne dispose que d’un clocheton. Des actes d’état civil datant du XVIe et XVIIe siècle, signés par les seigneurs de Lesparre et conservés dans les archives de la mairie, attestent que ce village appartient jusqu’à la révolution à la seigneurie de Lesparre, qui possède alors presque l’e