L'essor de la batellerie commence en 1855, les péniches naviguent sur la Seine vers Paris et approvisionnent ainsi la capitale en plein développement urbain. Après la propulsion des bateaux par le touage, les remorqueurs s'imposeront et plusieurs compagnies ont leur port d'attache à Conflans et Andrésy sa voisine : les Bleus, les Guêpes, les Tritons.
En 1892, la compagnie des chemins de fer de l'Ouest crée la ligne Argenteuil-Mantes, qui met Conflans à 40 minutes de la gare Saint-Lazare. Cela permettent aux Parisiens de venir en villégiature sur les bords de la Seine et de l'Oise.
L'un des grands moments de l'année est "Le Pardon National de la Batellerie", généralement célébré le 3ème week-end de juin et le dimanche. Cette fête patriotique et religieuse a été imaginée dès 1958. À cette occasion, un flambeau allumé le vendredi soir sur la Tombe du Soldat inconnu à Paris, descend la Seine le samedi sur un bateau. Il est accompagné d'autres embarcations jusqu'à Conflans afin d'allumer une grande vasque disposée devant le monument aux morts de la batellerie situé au Pointil, confluent des deux cours d'eau. Le lendemain, dimanche, est célébrée sur l'eau la Messe des Bateaux.
De part sa situation géographique au confluent de l'Oise et de la Seine et grâce au développement industriel lors du 19ème siècle, Conflans-Sainte-Honorine s'est imposée comme la Capitale de la Batellerie. Ainsi, la ville dispose aujourd'hui d'un patrimoine fluvial d'une grande richesse et demeure un port d'attache cher aux mariniers. La ville possède aussi une gendarmerie fluviale qui a compétence sur la Seine et l'Oise.