Sa superficie totale est proche des 450 km2. Il couvre un territoire qui s'étend des Moutiers en Retz jusqu'à la forêt de Monts et Machecoul.
A Villeneuve en Retz, le marais se situe au sud entre le port du collet et Fresnay. Autrefois, il était recouvert par la mer et formait jusqu'à Noirmoutier le golfe de Machecoul.
De nombreuse espèces d'oiseaux et d'animaux y habitent au gré des saisons; avocettes, aigrettes, cignes, hérons, ragondins, canards, rapaces, busards, cigognes...
On y pénétre à pied, à cheval et même à vélo... Cette zone est reconnue comme zone humide d'importance internationale (convention RAMSAR) pour la protection des oiseaux et notamment pour leur nidification.