Situé dans une reculée jurassienne caractéristique, on y trouve la résurgence d'un des réseaux spéléologiques les plus vastes de France, le Verneau souterrain dont plusieurs accès se trouvent sur la commune de Déservillers, à 7 km de là.
Depuis 2002, Nans-sous-Sainte-Anne est équipé d'une via ferrata, "les Baumes du Verneau".
Un ruisseau, le Verneau traverse le village et se jette dans le Lison, lui-même un affluent de la Loue. Les sources des deux rivières précitées offrent un grand attrait touristique.
Enfin, une taillanderie (forge fabricant des outils de coupe tels des faux) datant du XIXe siècle, en parfait état de fonctionnement est visitable. Elle appartenait aux frères Philibert.