Le Faou exportait du bois pour alimenter la construction navale de Brest mais la ville possédait ses propres chantiers, de part et d’autre de la rivière. La cité a compté quatre chantiers navals et au XVIIe siècle, un tiers des bateaux de la rade de Brest était construit au Faou.
Aujourd’hui, cette activité a cessé sans laisser de trace.