La commune de l'Isle-sur-le Doubs dispose d'une halte fluviale, équipée de bornes électriques, une borne pour l'eau et une vidange bateau. Elle est située à proximité des commerces et du centre-ville.
Le château d'Isle-sur-le-Doubs fut vendu pour bien public en cours d’année 1795 aux frères Bouchot.
Ils le démantelèrent et construisirent à la place des forges. Les fils de ceux-ci la vendirent en 1846 aux frères Japy de Beaucourt. Par une habile politique industrielle, les frères Japy fabriquaient vis et boulons. Ils avaient donné une impulsion nouvelle à la ville. En 1851, la ville avait doublé sa population.
En 2009, cette visserie a fermé définitivement après avoir changé de place et de nom.
- L'église de la nativité de la Très Sainte-Vierge : vers 1263, Thiébaud III de Neuchâtel construit la première église sous le vocable de la Vraie Croix dont il en aurait ramené un fragment de la cinquième croisade. Elle fut incendiée par les troupes d'invasion en 1475, puis complètement détruite pendant la guerre de Dix Ans. Reconstruite en 1684, elle tombe en ruines en 1732, nécessitant sa restauration en 1784.
Elle s'avère vite trop petite, car la population augmente au cours de siècles suivants. Elle est donc reconstruite en 1854. Seul le clocher a été conservé.
Elle est consacrée le 14 septembre 1856 par le cardinal Mathieu, archevêque de Besançon.
Elle conservait de l'ancienne église de la Sainte-Croix un reliquaire et un calice d'argent daté de 1442, le reliquaire en forme de croix de 1575 et un coffret orné d'un médaillon représentant Sainte-Catherine d'Alexandrie : le tout fut volé dans les années 1980.