L’histoire de cet édifice ne nous est que très peu connue. Elle est citée dans la liste de 1398 des paroisses du diocèse. Son histoire s’éclaire au XVIème siècle. En 1569,l’union de l’église Saint-Martin de Montagne au doyenné de Saint-Emilion est proclamée par l’archevêché.
Cette église possède un plan en croix latine typique du XIIème siècle. La nef unique couverte de voûte au XIXème siècle, se poursuit à l’est par un large transept très saillant, lui-même voûté dès l’époque romane. Cette partie de l’église possède la particularité de posséder trois types de voûtes : une coupole sur le bras nord, une coupole nervée sur le carré du transept et une voûte en berceau brisé sur le bras sud. Ce monument est classé au titre de Monument Historique.