La gare de Lignan-de-Bordeaux est établie sur la ligne Bordeaux-La Sauve, inaugurée en 1873 et prolongée vers Sauveterre-de-Guyenne en 1899.
Cette gare est aujourd’hui l’une des rares à avoir conservé son aspect originel. Elle présente une façade simple, dont seules les ouvertures sont mises en valeur par un léger décrochement du mur.