De Martres-Tolosane à Saint-Martory, le tracé proposé présente quelques variantes avec le GR balisé.
De Martres, prendre le chemin qui part à droite devant la gendarmerie. Après être passé sous l'autoroute, rejoindre une petite route jusqu'au sentier qui monte au lit de saint Vidian.
La Via Garona balisée reste sur la route en contrebas du coteau et rejoint le centre de Boussens. Si vous n'avez pas besoin de faire étape ou de vous ravitailler dans le village, vous pouvez suivre le trajet proposé qui est plus court de 2km. Monter par le sentier en direction du lit de saint Vidian. Ce sentier se prolonge jusqu'à la route qui mène à la Métairie des Pauvres. Continuer en prolongement et passer sous le tapis de l'usine Lafarge puis descendre par ce chemin jusqu'au vallon (stèle) pour retrouver le balisage. Remonter le vallon jusqu'à la ligne à haute tension pour monter sur le versant en face. Un chemin part ensuite sur la droite puis une route permet de rejoindre la route Boussens-Aurignac.
Le chemin s'engage dans le vallon en face le long d'un petit ruisseau. Le traverser pour rapidement partir à gauche dans les bois (la Via Garona est balisée plus en amont du ruisseau que le tracé proposé). Par des chemins dans les bois, il rejoint Cap del Bosc pour redescendre ensuite vers Mancioux par le pont dit "romain". Le balisage Via Garona évite le passage par ce pont pour un autre en amont.
Rejoindre Saint-Martory par la petite route qui monte au château de Montpezat puis par le sentier qui rejoint la vallée de la Garonne.