L’origine des cagots est mal définie : est-elle médicale ? Les lépreux ont été au Moyen Âge assimilés aux cagots, par la suite la lèpre semble devenir un alibi. Ethnique ? C’est-à-dire descendants des Wisigoths ? Religieuse ? Par exemple, descendants des Maures ?
Leur existence est attestée depuis le XIIe siècle, à l’époque sous le nom de crestias, et leur ségrégation perdurera dans les Pyrénées jusqu’à la moitié du XXe siècle.