"Malans est blotti au fond d'un vallon, découpé dans le plateau d'Amancey. Le ruisseau de "Bietard" et celui "du val d'Anchet" entourent la motte du bois de Crimont et le village avant de se rejoindre.
La localité de Malans s'étire en longueur entre deux ruisseaux. Elle est à 440 m d'altitude et le point culminant du territoire communal est à 592 m au sud du village à la limite avec le village de Coulans au " grand trembloi".